| MirGeneDB ID | Cel-Mir-1832-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1832 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-1832a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cel-Mir-1832-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrIII: 11829248-11829311 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGGCGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUCAAGCUCAGAUUUGAAUUCCGACCAAUCAGCGAUUCGAACUCCGCCCACUGCACCUGAUUGGUUGACAAGUGGGCGGAGCGAAUCGAUGAUUGGUCGGGGGUUCUCAUUUUGGAGGGAAUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAUCAAGCUCAGAUUUGAA--| G AA GCACCUGA UUCCGACCAAUCA CGAUUCG CUCCGCCCACU U GGGGCUGGUUAGU GCUAAGC GAGGCGGGUGA U UUAAGGGAGGUUUUACUCUUG^ A -- ACAGUUGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-1832-P1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0032039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGCGAUUCGAACUCCGCCCACU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-1832-P1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UGGGCGGAGCGAAUCGAUGAU -64
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0006774 TargetScanWorm: cel-miR-1832 |
