| MirGeneDB ID | Cel-Mir-243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-243 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrIV: 4450798-4450861 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCUCGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CACAGAAAUUCUGUUCACGCAUAAGCCUGAUAUCUCGGUGCGAUCGUACCGUAUCGCUCACACUUAGAUUACGGUACGAUCGCGGCGGGAUAUCAGGUACGUGAUUGGAAGCUGUGCAAUUCUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CACAGAAAUUCUGUUCACG--| AA G UCGCUCA CAU GCCUGAUAUCUCG UGCGAUCGUACCGUA C GUG UGGACUAUAGGGC GCGCUAGCAUGGCAU A GUCUUAACGUGUCGAAGGUUA^ CA G UAGAUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cel-Mir-243_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0015117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAUCUCGGUGCGAUCGUACCGUA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015117 |
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| Co-mature sequence | Cel-Mir-243_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CGGUACGAUCGCGGCGGGAUAUC -64
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000299 TargetScanWorm: cel-miR-243 |
