| MirGeneDB ID | Cel-Mir-784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-784 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cbr-Mir-784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 8074934-8074996 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCACAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCGUAUUCUCAGUUUUUCGACGUCCACGUGGCACAAUCUGCGUACGUAGAAAGAUCAAAAAGUCACUUCUAUGUACAAAUGUUGCGCUGCCUGGCACAGUGAAUGAAUUUAUGGGUUAAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUUCGUAUUCUCAGUUU- AC -| C UG A CUGC AAGAUCAA UUCG GU CCA G GC CAAU GUACGUAGA \ AAGU CA GGU C CG GUUG CAUGUAUCU A AAAAUUGGGUAUUUAAGU GA C^ C GU C UAAA UCACUGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cel-Mir-784_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0004219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGCACAAUCUGCGUACGUAGA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004219 TargetScanWorm: cel-miR-784 |
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| Star sequence | Cel-Mir-784_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UAUGUACAAAUGUUGCGCUGCC -63
Get sequence
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