| MirGeneDB ID | Cel-Mir-799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-799 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 8600657-8600718 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAACCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUAAAAUAUGUUAGUUUUUCAAUUUUUUUCACCGGUUUUAAAAAGUGGUUUCACAUUCAAUAAAGACAUGUGAACCCUGAUAAAGCUAGUGGAAAUAUCGGAAAACAUUGUUAGGAGCAUAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAAAAUAUGUUAGUUU--| AAUUU CG AAA U U UUCAAU UUC UUUUCAC GUUUUA AG GGUU CACA \ AAG AAAGGUG CGAAAU UC CCAA GUGU A UAUACGAGGAUUGUUACAA^ GCUAU AU AG- - - ACAGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-799_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCGGUUUUAAAAAGUGGUUUCACA -25
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-799_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGAACCCUGAUAAAGCUAGUGG -62
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004234 TargetScanWorm: cel-miR-799 |
