| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-423 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-423a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-423 Cja-Mir-423 Cpo-Mir-423 Dno-Mir-423 Eca-Mir-423 Ete-Mir-423 Hsa-Mir-423 Laf-Mir-423 Mml-Mir-423 Mmr-Mir-423 Mmu-Mir-423 Ocu-Mir-423 Pab-Mir-423 Rno-Mir-423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr9: 44155913-44155971 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGGGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAACUUGUGAGGAAAUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGCUUGAGUUUCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAACUUGUGAGGAAAUAA-- U AG-| G A UCUAU AGGAAGU AGGCUGAGGGGC AGA CGAG CUUU \ UCCUUCG UCUGACUCCCCG UCU GCUC GAAA U CUCUUUGAGUUCGCGCCCCA U GAG^ G - ACCUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-423_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-423a miRDB: MIMAT0006742 |
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| Co-mature sequence | Cfa-Mir-423_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGU -59
Get sequence
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