| MirGeneDB ID | Dme-Mir-1010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1010 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-1010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-1010 Dmo-Mir-1010 Dsi-Mir-1010 Dya-Mir-1010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 22292879-22292949 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUCACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGUACACCUCCGUCUUUGUGCUCAACGGGUAAGUGGUGUAGAUGAAACAAAUUUACCAACAAUUUUGUUGGAUUGUUUCACCUAUCGUUCCAUUUGCAGCUACGAGGACCUGGAACUGUUCAAGGAACUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGAGUACACCUCCGUCUUU- G AACGG- U---| A AAUUUACCAAC GU CUC GUAAGUGG GUAG UGAAACA A CA GAG CGUUUACC UAUC ACUUUGU A UCAAGGAACUUGUCAAGGUC G CAUCGA UUGC^ C UAGGUUGUUUU . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-1010_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020905 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAAGUGGUGUAGAUGAAACA -21
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-1010_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
47- UUUCACCUAUCGUUCCAUUUGCAG -71
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005023 TargetScanFly: dme-miR-1010 |






