| MirGeneDB ID | Dme-Mir-927-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-927 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-927-P1 Aga-Mir-927-P1 Bge-Mir-927-P1 Dan-Mir-927-P1 Dlo-Mir-927-P1 Dmo-Mir-927-P1 Dsi-Mir-927-P1 Dya-Mir-927-P1 Gpa-Mir-927-P1-v1 Hme-Mir-927-P1 Tca-Mir-927-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 15965962-15966023 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUAGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGCAAUAUUAAAUUGUGGUUGCUGUAGAGUUUUAGAAUUCCUACGCUUUACCGUGGCAUACGAAAUUCGGCAAAGCGUUUGGAUUCUGAAACCCUACCGAUCCAUUAUCAUGUUAAAAAAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGCAAUAUUAAAUUGUG----| CU A CU A GUGGCAU GUUG GUAG GUUUUAGAAUUC ACGCUUU CC A UAGC CAUC CAAAGUCUUAGG UGCGAAA GG C AAAAAAAAUUGUACUAUUACC^ -- C UU C CUUAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dme-Mir-927-P1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0005501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUAGAAUUCCUACGCUUUACC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005501 TargetScanFly: dme-miR-927 |
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| Star sequence | Dme-Mir-927-P1_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CAAAGCGUUUGGAUUCUGAAAC -62
Get sequence
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