| MirGeneDB ID | Dme-Mir-985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-985 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dsi-Mir-985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 16191270-16191324 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAAUGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUAUAAUUAUAUUAUAUAUAAUAGCACUGCUGGCUCAUUGGUACAUUUCAUAAGUACCUUAUCAAAUGUUCCAAUGGUCGGGCAGAGCUAUUAUUUGUCCAUGUUUUGGACUAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUUAUAAUUAUAUUAUAU-- A -| U U C AAGU AUAAUAGC CUG CUGGC CAUUGG ACAUUU AU \ UAUUAUCG GAC GGCUG GUAACC UGUAAA UA A GAUCAGGUUUUGUACCUGUU A G^ - U C UUCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-985_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUGGCUCAUUGGUACAUUUCAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-985_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- CAAAUGUUCCAAUGGUCGGGCA -55
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005502 TargetScanFly: dme-miR-985 |






