| MirGeneDB ID | Eba-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2722 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Epimenia (Solenogaster) (Epimenia babai) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-2722 Esc-Mir-2722 Hru-Mir-2722 Lgi-Mir-2722 Lhy-Mir-2722 Mgi-Mir-2722 Mom-Mir-2722 Npo-Mir-2722 Obi-Mir-2722 Ovu-Mir-2722 Pve-Mir-2722 Rph-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011762755.2_ASM1176275v2_Epimenia) |
WURV02051454.1: 7248-7310 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACACAUAUUUUUAUGCCGGUCGGUGCGGGUGAGGUGUUUCACGGGCGGACCACUGUGUCAAAGUAGUCAAGUGGCGCCGUGUAAACAUCUAACUCGAAUCUACAACAGCCAGCACCACGACUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACACAUAUUUUUAUGCCG-- C G G - -| GGACCACUGUGUC GU GGU CGGGU AGGUGUUU CACGG GC \ CA CUA GCUCA UCUACAAA GUGCC CG A GUCAGCACCACGACCGACAA U A A U G^ GUGAACUGAUGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Eba-Mir-2722_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGGUGUUUCACGGGCGGAC -20
Get sequence
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| Mature sequence | Eba-Mir-2722_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UGGCGCCGUGUAAACAUCUAAC -63
Get sequence
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