| MirGeneDB ID | Ebu-Mir-153-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Inshore hagfish (Eptatretus burgeri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ebu-Mir-153-P6 Ebu-Mir-153-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-153 Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bko-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Cin-Mir-153 Cte-Mir-153 Dgr-Mir-153 Dma-Mir-153 Dpu-Mir-153 Eba-Mir-153 Egr-Mir-153 Gsa-Mir-153 Gsp-Mir-153 Hmi-Mir-153 Hru-Mir-153 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lgi-Mir-153 Llo-Mir-153 Mgi-Mir-153 Mom-Mir-153 Npo-Mir-153 Obi-Mir-153 Ofu-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pau-Mir-153 Pca-Mir-153 Pcr-Mir-153 Pdu-Mir-153 Pfl-Mir-153 Pmi-Mir-153 Pve-Mir-153 Rph-Mir-153 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Snu-Mir-153 Spu-Mir-153 Tur-Mir-153 War-Mir-153 Xbo-Mir-153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. burgeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Eburgeri_3) |
FYBX02010433.1: 28628-28686 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAUUCCACCCUGCCUGCCCUCUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUGCAGCUCCGUUACCGAAUACAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAGGAUGGGCUAAAGCUCGGCCAGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50
ACAUUCCACCCUGCCUG- C G - -| CCGUUA
CC UCU CCAGUG UCAUUUUUGUGA UGUGCAGCU C
GG AGG GGUUAC AGUGAAAACACU AUACGUUGA C
UGGACCGGCUCGAAAUCG U A U G^ CAUAAG
110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ebu-Mir-153-P5_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAUUUUUGUGAUGUGCAGCU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Ebu-Mir-153-P5_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUGCAUAGUCACAAAAGUGAUC -59
Get sequence
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