| MirGeneDB ID | Gja-Mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-737 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Schlegels Japanese gecko (Gekko japonicus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-737 Ami-Mir-737 Cli-Mir-737 Cpi-Mir-737 Dre-Mir-737 Gmo-Mir-737 Lch-Mir-737 Loc-Mir-737 Mal-Mir-737 Mun-Mir-737 Oan-Mir-737 Pbv-Mir-737 Spt-Mir-737 Tni-Mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_001447785.1_Gekko_japonicus) |
NW_015163661.1: 267448-267508 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUGUCCUGCGACGCCUGCUACUCUGCUGUUAUUUUUUUAGGUUUUGAUUUUUAUGGCGUGCUCACGCGAAAAUCAAAACCUAAAGAAAACGCGGCAAAGAUAGAUUCUUCUCCUGCAGUCGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUGUCCUGCGACGCCUG- -| C UA AUGGCGU CUA CU UGCUGU UUUUUUUAGGUUUUGAUUUUU \ GAU GA ACGGCG AAAGAAAUCCAAAACUAAAAG G GCUGACGUCCUCUUCUUA A^ A CA CGCACUC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Gja-Mir-737_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUUUUUUAGGUUUUGAUUUUU -22
Get sequence
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| Star sequence | Gja-Mir-737_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAAUCAAAACCUAAAGAAAACG -61
Get sequence
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