| MirGeneDB ID | Laf-Mir-708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-708 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-708 Cfa-Mir-708 Cja-Mir-708 Cpo-Mir-708 Dno-Mir-708 Eca-Mir-708 Ete-Mir-708 Hsa-Mir-708 Mml-Mir-708 Mmr-Mir-708 Mmu-Mir-708 Ocu-Mir-708 Pab-Mir-708 Rno-Mir-708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010089.1: 2376149-2376217 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGAGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUGCUGUGUGUGAAAUGGUGACUGCCCUCAAGGAGCUUACAAUCUAGCUGGGGGUAAAAGACUUGCACAUAAACGCAACUAGACUGUGAGCUUCUAGAGGGCAGGGACCUUACCCUAGUCAUCUCUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACUGCUGUGUGUGAAAU--| GA A A C GGGGUAAAAGAC GGU CUGCCCUC AGGAGCUUACA UCUAG UG \ CCA GACGGGAG UCUUCGAGUGU AGAUC AC U UCUCUCUACUGAUCCCAUU^ GG A C A GCAAAUACACGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Laf-Mir-708_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGGAGCUUACAAUCUAGCUGGG -23
Get sequence
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| Star sequence | Laf-Mir-708_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
46- CAACUAGACUGUGAGCUUCUAGA -69
Get sequence
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