| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-186 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmr-mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-186 Cfa-Mir-186 Cja-Mir-186 Cpo-Mir-186 Dno-Mir-186 Eca-Mir-186 Ete-Mir-186 Hsa-Mir-186 Laf-Mir-186 Mdo-Mir-186 Mml-Mir-186 Mmu-Mir-186 Neu-Mir-186 Oan-Mir-186 Ocu-Mir-186 Pab-Mir-186 Rno-Mir-186 Sha-Mir-186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mammalia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007662.1: 6567929-6567989 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAAGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUACACAUUUUUUCAUUGCUUAUAACUUUCCAAAGAAUUCUCUUUUUGGGCUUUCUGGUUUUAUUUUAAACCCAAAGGUGAAUUUUUUGGGAAGUUUGAGCUAAAUUCCUUCAACCAAAAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUACACAUUUUUUCAUU---| U U U CUUUCUGGU GCUUA AACUUUCCAAAGAAUUC CUUUU GGG U CGAGU UUGAAGGGUUUUUUAAG GGAAA CCC U UAAAACCAACUUCCUUAAAU^ - U - AAAUUUUAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-186_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0049155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAAGAAUUCUCUUUUUGGGCUU -23
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-186_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CCCAAAGGUGAAUUUUUUGGG -61
Get sequence
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