| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3059 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-3059 Cfa-Mir-3059 Cja-Mir-3059 Cpo-Mir-3059 Dno-Mir-3059 Eca-Mir-3059 Ete-Mir-3059 Hsa-Mir-3059 Laf-Mir-3059 Mml-Mir-3059 Mmu-Mir-3059 Ocu-Mir-3059 Pab-Mir-3059 Rno-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007667.1: 34472607-34472664 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUACACAGGUGUAACACAGGUGGUACGCCCUUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGUAGCUCUAACUACCCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGGGUGAACAGCCUUACUAUUUCUUCAGCUCAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUACACAGGUGUAACAC--| G A UUU - G CAU UAGC AGGU GU CGCCC CCU CUCU CCC AGGGUG U UCCG CA GUGGG GGA GAGA GGG UCCCAU C GACUCGACUUCUUUAUCAU^ A A UU- A A AUC CAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-3059_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGU -24
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-3059_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGG -58
Get sequence
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