| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1953 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 151967543-151967602 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGGAAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAUUUCUCCCCCAGGUGCUGCCUGGUCUUGGGAAAGUUCUCAGGCUUCUGAGAAUUUGCAGGAGCAGAAGGCUGUGAGGUUCCCCUCUUCCUGGCAGCCCUAAGAUCUGGGGAGCCAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUGAUUUCUCCCCCAGGU--| U UCUU A G U G AGAAUU GCUGCC GG GGG AA UUC CAG CUUCUG U CGACGG CC CCC UU GAG GUC GAAGAC G GACCGAGGGGUCUAGAAUCC^ U UUCU C G U G GAGGAC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1953_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGGAAAGUUCUCAGGCUUCUG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009424 TargetScanVert: mmu-miR-1953 miRDB: MIMAT0009424 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1953_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- GAAGGCUGUGAGGUUCCCCUCU -60
Get sequence
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