| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3061 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr11: 52126759-52126825 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGUGGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGUACCUUGAUAUAUUGUGUACUGUGGGGCAGUGGGCCGUGAAAGGUAGCCUGGUGGUCCCCUUUGAGCUAAGGCUACCUUUGAUAGUCCACUGCCCCACGGUGCAUGCAUUGGUGUUUUUCGGUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGUACCUUGAUAUAUU--| CG G UGGUGGUCCC GUGUACUGUGGGGCAGUGGGC U AAAGGUAGCC \ UACGUGGCACCCCGUCACCUG A UUUCCAUCGG C AUGGCUUUUUGUGGUUACG^ AU G AAUCGAGUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3061_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGUGGGCCGUGAAAGGUAGCC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3061-5p miRDB: MIMAT0014828 |
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| Co-mature sequence | Mmu-Mir-3061_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
45- CUACCUUUGAUAGUCCACUGCC -67
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3061-3p miRDB: MIMAT0014829 |






