| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3066 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr12: 17355404-17355463 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGGUUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUAAAAUGGGAGUGAGUAGUGUGGUAUGUUUUGGUUGCUGUAGAUUAAGUAGUUUAAUAUGAUGCUGCACUUAAUAGACCGCAACCUGCACUGGCCAUGCUCUGGGCUGCGCACAGGGCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUAAAAUGGGAGUGAGU--| AU UUU U AG A UUAAUA AGUGUGGU GU GGUUGC GU AUUAAGU GU \ UCGUACCG CA CCAACG CA UAAUUCA CG U UCGGGACACGCGUCGGGUC^ GU CGU C GA - UCGUAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3066_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUGGUUGCUGUAGAUUAAGUAGU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3066-5p miRDB: MIMAT0014838 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3066_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACUUAAUAGACCGCAACCUGCA -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3066-3p miRDB: MIMAT0014839 |
