| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3079 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr15: 76290892-76290954 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGAUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCCCAGACAACCUCUGCCAAGCUAAGGACUUUGAUCUGAUGAGCUAAGCUGGAGUUCCCAUUCACCUGGCUCCAGGCUCAUCAGAUGAAAGUCCUUAGCUUAGGUGUGGCCUUUGUUGGAGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCCCAGACAACCUCUG- -| G UAAG GUUCCCAU CC AAGCUAAGGACUUU AUCUGAUGAGC CUGGA \ GG UUCGAUUCCUGAAA UAGACUACUCG GACCU U UGAGGUUGUUUCCGGUGU A^ G ---- CGGUCCAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3079_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUGAUCUGAUGAGCUAAGCUGGA -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3079-5p miRDB: MIMAT0014866 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3079_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- CAGGCUCAUCAGAUGAAAGU -63
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3079-3p miRDB: MIMAT0014867 |
