| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3091 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 180257547-180257601 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGGCCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCGGUCACAUGGCCGAGAGUGCUUGCGGGCCAUGGGUCUGGUUGGGCCCGCAGACUCGGAGUGCGGGCCUGACCAGUCUCAAGACCUGCGUGGUAACUCUGCAGGGACGGCCUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCGGUCACAUGGCCGAGAG- -| CCA U UG GACU UGCU UGCGGG UGGG CUGGU GGCCCGCA \ AUGG GCGUCC ACUC GACCA CCGGGCGU C ACUCCGGCAGGGACGUCUCA U^ AGA U GU GAGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-3091_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014903 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAUGGGUCUGGUUGGGCCCGCA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3091-5p miRDB: MIMAT0014903 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3091_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- CGGGCCUGACCAGUCUCAAGAC -55
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3091-3p miRDB: MIMAT0014904 |
