| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3095 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr4: 58441023-58441085 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGACACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCCGAGGAUCCACCCAGAGCCCUGUGCACAAGCUUUCUCAUCUGUGACACUCGAGAUGGUUUCAGGGAGUGGACACUGGAGAGAGAGCUUUUGCAAGUCGCUCCUCAUGCCUUGUGGGGUAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGCCGAGGAUCCACCCA-- CCUG C A - A-| CGAGAUG GAGC UGCA AAGCUUUCUC UCU GUG CACU G CUCG ACGU UUCGAGAGAG AGG CAC GUGA U GAUGGGGUGUUCCGUACUC CUGA U - U AG^ GGGACUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-3095_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGCUUUCUCAUCUGUGACACU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3095-5p miRDB: MIMAT0014911 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3095_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGGACACUGGAGAGAGAGCUUUU -63
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3095-3p miRDB: MIMAT0014912 |
