| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3110 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 38210453-38210509 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCUGCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGGACCCCAUUAUGGACUGUGGGGCUGUGUUCUGCCUCCCCUGAAGGCUCUGUUGUCACUCUGGGCACUCCAUCGGAGGCAGACACUCAACCCCACACUUUGCCAUCUUCCAUGUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAGGACCCCAUUAUGGAC- C U - CC A -| UGUUG UGUGGGG UG GU UCUGCCUCC UG AG GCUC U ACACCCC AC CA AGACGGAGG AC UC CGGG C CUGUACCUUCUACCGUUUC A U C CU C A^ UCUCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3110_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUGCCUCCCCUGAAGGCUC -21
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3110-5p miRDB: MIMAT0014951 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3110_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- GCACUCCAUCGGAGGCAGACAC -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3110-3p miRDB: MIMAT0014952 |
