| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-32 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-32 Ami-Mir-32 Bta-Mir-32 Cfa-Mir-32 Cja-Mir-32 Cli-Mir-32 Cmi-Mir-32 Cpi-Mir-32 Cpo-Mir-32 Dno-Mir-32 Eca-Mir-32 Ete-Mir-32 Gga-Mir-32 Gja-Mir-32 Hsa-Mir-32 Laf-Mir-32 Lch-Mir-32 Mdo-Mir-32 Mml-Mir-32 Mmr-Mir-32 Mun-Mir-32 Neu-Mir-32 Oan-Mir-32 Ocu-Mir-32 Pab-Mir-32 Pbv-Mir-32 Rno-Mir-32 Sha-Mir-32 Spt-Mir-32 Sto-Mir-32 Tgu-Mir-32 Xla-Mir-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr4: 56895232-56895293 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGAGGUUCCCUCUGCUUGCUCUGGUGGAGAUAUUGCACAUUACUAAGUUGCAUGUUGUCACGGCCUCAAUGCAAUUUAGUGUGUGUGAUAUUUUCACAUGAGUGCAUGCACACGGGUCUGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGAGGUUCCCUCUGCUU--| UG UG U UGUUGUCA GCUC GUGGAGAUAU CACAU ACUAAGUUGCA \ UGAG CACUUUUAUA GUGUG UGAUUUAACGU C GGGUCUGGGCACACGUACG^ UA GU - AACUCCGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-32_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAUUGCACAUUACUAAGUUGCA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000654 TargetScanVert: mmu-miR-32-5p miRDB: MIMAT0000654 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-32_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAUUUAGUGUGUGUGAUAUU -62
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-32-3p miRDB: MIMAT0017050 |
