| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-331 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-331 Cfa-Mir-331 Cja-Mir-331 Cpo-Mir-331 Dno-Mir-331 Eca-Mir-331 Ete-Mir-331 Hsa-Mir-331 Laf-Mir-331 Mml-Mir-331 Mmr-Mir-331 Ocu-Mir-331 Pab-Mir-331 Rno-Mir-331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 93963783-93963838 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCCCUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAAGGAGUCUGGUUUUGUUUGGGUUUGUUCUAGGUAUGGUCCCAGGGAUCCCAGAUCAAACCAGGCCCCUGGGCCUAUCCUAGAACCAACCUAAACCCGUGCAUCAUUCCUGGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAAGGAGUCUGGUUUU--| U U U AU CCAGAU GUUUGGGUU GUUCUAGG AUGG CCCAGGG C \ CAAAUCCAA CAAGAUCC UAUC GGGUCCC G C AAGGUCCUUACUACGUGCC^ C - C CG ACCAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-331_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUAGGUAUGGUCCCAGGGAUCC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004643 TargetScanVert: mmu-miR-331-5p miRDB: MIMAT0004643 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-331_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- GCCCCUGGGCCUAUCCUAGAA -56
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000571 TargetScanVert: mmu-miR-331-3p miRDB: MIMAT0000571 |
