| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-511 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-511 Cpo-Mir-511 Hsa-Mir-511 Mml-Mir-511 Mmr-Mir-511 Pab-Mir-511 Rno-Mir-511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 14261012-14261072 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUGUGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAGCAACAAGUAACCAAAUAGAUACCCACCAUGCCUUUUGCUCUGCACUCAGUAAAUAAUAAUUUGUGAAUGUGUAGCAAAAGACAGGAUGGGGAUCCAUUAAAUCCCAAGGAUGACGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAGCAACAAGUAACCA-- A A -| A C CU C GUAAAUA AAU GAU CCCA CC UG CUUUUGCU GCA UCA \ UUA CUA GGGU GG AC GAAAACGA UGU AGU A CAGCAGUAGGAACCCUAAA C G A^ - A UG A GUUUAAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-511_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAUGCCUUUUGCUCUGCACUCA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004940 TargetScanVert: mmu-miR-511-5p miRDB: MIMAT0004940 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-511_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0017281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAUGUGUAGCAAAAGACAGGAU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-511-3p miRDB: MIMAT0017281 |
