| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1251 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1251 Cfa-Mir-1251 Cja-Mir-1251 Cpo-Mir-1251 Dno-Mir-1251 Eca-Mir-1251 Ete-Mir-1251 Hsa-Mir-1251 Laf-Mir-1251 Mdo-Mir-1251 Mml-Mir-1251 Mmr-Mir-1251 Mmu-Mir-1251 Neu-Mir-1251 Pab-Mir-1251 Rno-Mir-1251 Sha-Mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr4: 76714498-76714556 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CACCCGAGCGUCCAUGGGUCAGCUAUGUGGACUCUAGCUGCCAAAGGCGCUUCUCCUUCUGAACAGAGCGCUUUGCUCAGCCAGUGUAGACAUGGCCUGAUAAACAAUGGAACUUCUCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CACCCGAGCGUCCAUGG- -| GG U A CCA UCUCCUU GUCA GCUAUGU AC CU GCUG AAGGCGCU \ UAGU CGGUACA UG GA CGAC UUUCGCGA C CCUCUUCAAGGUAACAAA C^ GA U C UCG GACAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-1251_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCUAGCUGCCAAAGGCGCU -21
Get sequence
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| Star sequence | Ocu-Mir-1251_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CGCUUUGCUCAGCCAGUGUAG -59
Get sequence
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