| MirGeneDB ID | Adi-Novel-6-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | ADI-NOVEL-6 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Stony coral (Acropora digitifera) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Adi-Novel-6-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | A. digitifera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | A. digitifera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000222465.2_Adig_1.1_genomic) |
DF970752.1: 428014-428066 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-6-P1) |
Novel-6-P2
DF970752.1: 427718-427770 [-]
Ensembl
Novel-6-P1 DF970752.1: 428014-428066 [-] Ensembl |
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| Seed | CUGCGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUACGUCACUGAAAAUCGGCCAUAGUCACAUUUCACUAGAUAAGCGCUAACUGUUAUUGUUCUGCGUUAUCGGUGAAAUUGUAACUGUUGCCUCCUAUUGCUUUUGCUUUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUUACGUCACUGAAAAUC-- C C -| A G U- UGU GGC AUAGU AC AUUUCACU GAUAA CGC AAC \ CCG UGUCA UG UAAAGUGG CUAUU GCG UUG U ACUUUCGUUUUCGUUAUCCU U A U^ - - UC UUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Adi-Novel-6-P1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUUCACUAGAUAAGCGCUAAC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Adi-Novel-6-P1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
31- UCUGCGUUAUCGGUGAAAUUGU -53
Get sequence
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