| MirGeneDB ID | Asp-Mir-2026-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2026 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Deep-sea anemone (Actinernus sp.) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Asp-Mir-2026-P1a Asp-Mir-2026-P1b Asp-Mir-2026-P2-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Nve-Mir-2026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Actinernus sp. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Anenthemonae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_030867875.1_CUHK_Acti_1.0_genomic) |
JAOWCC010000577.1: 179329566-179329616 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2026-P2-v2) |
Mir-2026-P2-v1
JAOWCC010000577.1: 179329566-179329616 [+]
Ensembl
Mir-2026-P2-v2 JAOWCC010000577.1: 179329566-179329616 [+] Ensembl |
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| Variant | Asp-Mir-2026-P2-v2 |
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| Seed | AACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACACGGAAUAGGUUUCUGAGUUCCUCCAAUUCAAAUAUCUACUGAUGGAAUUUAAUUCCAACAGUUGGUAUUUGAACCUGUGGGUCUCAGACUGAGCAGAGGAUUAACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGACACGGAAUAGGUUU--| UU UC A- U A AAUU CUGAG CC CA UUCAAAUAUC ACUG UGG \ GACUC GG GU AAGUUUAUGG UGAC ACC U GCAAUUAGGAGACGAGUCA^ U- GU CC U A UUAA . 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Asp-Mir-2026-P2-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUCAAAUAUCUACUGAUGG -20
Get sequence
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| Mature sequence | Asp-Mir-2026-P2-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
30- CAACAGUUGGUAUUUGAACCU -51
Get sequence
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| Variant | Asp-Mir-2026-P2-v1 |
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| Seed | UUCAAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACACGGAAUAGGUUUCUGAGUUCCUCCAAUUCAAAUAUCUACUGAUGGAAUUUAAUUCCAACAGUUGGUAUUUGAACCUGUGGGUCUCAGACUGAGCAGAGGAUUAACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGACACGGAAUAGGUUU--| UU UC A- U A AUU CUGAG CC CA UUCAAAUAUC ACUG UGGA \ GACUC GG GU AAGUUUAUGG UGAC ACCU U GCAAUUAGGAGACGAGUCA^ U- GU CC U A UAA . 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Asp-Mir-2026-P2-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUCAAAUAUCUACUGAUGGA -21
Get sequence
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| Co-mature sequence | Asp-Mir-2026-P2-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
29- CCAACAGUUGGUAUUUGAACCU -51
Get sequence
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