| MirGeneDB ID | Cel-Mir-230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-230 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cbr-Mir-230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 5803908-5803974 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-230) |
Mir-230
chrX: 5803908-5803974 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-791 chrX: 5809361-5809423 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUUGGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUUGUCUGAUGUUGAUGUAAUGCCGUCACUUGGUCGGCGAUUUAAUAUUAUCAGAACAUAGGAAAUUGUUAGUAUUAGUUGUGCGACCAGGAGACGGUAUUCGCAUAUUUCUUAAAUAUUCAUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUUUUGUCUGAUGUUG- - A -| U UCAGAACAU AUGU AAUGCCGUC CUUGGUCG GCGAUU AAUAUUA \ UACG UUAUGGCAG GGACCAGC UGUUGA UUAUGAU A UUACUUAUAAAUUCUUUA C A G^ - UGUUAAAGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cel-Mir-230_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0015113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUUGGUCGGCGAUUUAAUAUUA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015113 |
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| Co-mature sequence | Cel-Mir-230_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- GUAUUAGUUGUGCGACCAGGAGA -67
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000285 TargetScanWorm: cel-miR-230 |






