| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-374b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cfa-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-374-P2 Cja-Mir-374-P2 Eca-Mir-374-P2 Hsa-Mir-374-P2 Laf-Mir-374-P2 Mml-Mir-374-P2 Mmu-Mir-374-P2 Ocu-Mir-374-P2 Pab-Mir-374-P2 Rno-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chrX: 57550217-57550268 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-374-P2) |
Mir-421-P2
chrX: 57550054-57550110 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-374-P2 chrX: 57550217-57550268 [-] UCSC Ensembl Mir-421-P1-v1 chrX: 57590222-57590284 [-] UCSC Ensembl Mir-421-P1-v2 chrX: 57590223-57590282 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 chrX: 57590394-57590445 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCUCUUCUGAAGAAAUCCUACUCGGAUGGAUAUAAUACAACCUGCUAAGUGUCCUAGCACUUAUCAGGUUGUAUUAUCAUUGUCCGUGGCUAUGGCUCUCGUCUACCAGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGCUCUUCUGAAGAAAUC----| UC UG AU C UC CUAC GGA G AUAAUACAACCUG UAAGUG C GGUG CCU U UAUUAUGUUGGAC AUUCAC U CAGACCAUCUGCUCUCGGUAUC^ -- GU AC U GA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-374-P2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUAUAAUACAACCUGCUAAGUG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-374b miRDB: MIMAT0006754 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-374-P2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
30- CUUAUCAGGUUGUAUUAUCAUU -52
Get sequence
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