| MirGeneDB ID | Cja-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-326 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-326 Cfa-Mir-326 Cpo-Mir-326 Dno-Mir-326 Eca-Mir-326 Ete-Mir-326 Hsa-Mir-326 Laf-Mir-326 Mml-Mir-326 Mmr-Mir-326 Mmu-Mir-326 Ocu-Mir-326 Pab-Mir-326 Rno-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021925.1: 62331668-62331727 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUUCCAGAGCCUCAUCUGUCUGUUGGGCUGGAGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCGGGUGGUGCUCAGAUCGCCUCUGGGCCCUUCCUCCAGCCCCGAGGCGGAUUCACCAUGAGGCUGACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCUUCCAGAGCCUCAUCUG --- C UU--| AGGCGGGU UCUGUU GGGCUGGAGG AGGGCCU GUGA G AGGCGG CCCGACCUCC UCCCGGG CGCU G ACAGUCGGAGUACCACUU- AGC U UCUC^ AGACUCGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cja-Mir-326_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGAGGCAGGGCCUUUGUGAA -20
Get sequence
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| Mature sequence | Cja-Mir-326_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG -60
Get sequence
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