| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-326 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-326 Cfa-Mir-326 Cja-Mir-326 Cpo-Mir-326 Dno-Mir-326 Eca-Mir-326 Ete-Mir-326 Hsa-Mir-326 Laf-Mir-326 Mml-Mir-326 Mmr-Mir-326 Ocu-Mir-326 Pab-Mir-326 Rno-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 99552288-99552347 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCUUCCGAGCCUCAUCUGUCUGUUGGGCUGGGGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCGGGUUAUGCUCAGAUCGCCUCUGGGCCCUUCCUCCAGUCCCGAGGCAGAUUUACUUCGAGGCAAAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCUUCCGAGCCUCAUCUG ---| C UUGUGA GGUUAU UCUGUU GGGCUGGGGG AGGGCCU AGGCG G AGACGG CCUGACCUCC UCCCGGG UCCGC C CAAAACGGAGCUUCAUUU- AGC^ U UC---- UAGACU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | This is likely a group 2 miRNA given the orthologues in other mammals but here the 3' terminal U on the 3p arm is templated. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-326_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCG -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-326-5p miRDB: MIMAT0017027 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-326_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000559 TargetScanVert: mmu-miR-326-3p miRDB: MIMAT0000559 |
