| MirGeneDB ID | Dan-Novel-12-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | DAN-NOVEL-12 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dan-Novel-12-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13045: 602935-602992 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-12-P2) |
Novel-12-P1
scaffold_13045: 592980-593037 [+]
Ensembl
Novel-12-P2 scaffold_13045: 602935-602992 [+] Ensembl |
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| Seed | AAAGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAAUACGUGUGCCCUUGCAUUCUCUGGCCAAAAGCUGGCGGAAAAAAUCGUCUUGAAUAUCUGACGAUUUGUUUCGGCAGCUUUUGGCCAAAGAAUAUUUUCGUCCAAGAACAUCAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAAAUACGUGUGCCCUUGC--| C G A CUUGA AUUCU UGGCCAAAAGCUG CGGAA AAAUCGU A UAAGA ACCGGUUUUCGAC GCUUU UUUAGCA U GACUACAAGAACCUGCUUUUA^ A G G GUCUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dan-Novel-12-P2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAAAGCUGGCGGAAAAAAUCGU -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dan-Novel-12-P2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- GAUUUGUUUCGGCAGCUUUUGG -58
Get sequence
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