| MirGeneDB ID | Dan-Novel-14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | DAN-NOVEL-14 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13117: 3425021-3425078 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-14) |
Novel-14
scaffold_13117: 3425021-3425078 [+]
Ensembl
Mir-970 scaffold_13117: 3438256-3438320 [+] Ensembl |
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| Seed | UUAAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUGGAGUUAAAAAUACUGUAAUUAUUGGCCUACGACAUGUUGAUUUAGUUUAUUUUUUAAGCCAAGUUAAAUAAACAAGUCGUAUGCCAAAAAUUAUGCAAGCCACAAGAUCGAUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUUGGAGUUAAAAAUACU--| A C A G GU AUUUU GUAAUU UUGGC UACGAC UGUU AUUUA UU U UAUUAA AACCG AUGCUG ACAA UAAAU AA U CUUAGCUAGAACACCGAACG^ A U A A UG CCGAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Novel-14_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUACGACAUGUUGAUUUAGUUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Novel-14_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- GUUAAAUAAACAAGUCGUAUGC -58
Get sequence
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