| MirGeneDB ID | Dmo-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dmo-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dmo-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6496: 24271692-24271757 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v1
scaffold_6496: 24271692-24271757 [+]
Ensembl
Mir-67-v2 scaffold_6496: 24271692-24271757 [+] Ensembl |
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| Variant | Dmo-Mir-67-v2 |
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| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAAACUAAGAAUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUUCGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGAUAGAAUAUCCACAAAGCUAAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGAAAACUAAGAAUU-- -| A CCU G GUUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGAU A GAUAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACUA U CAAAUCGAAACACCUAUAA U^ - CCU A CCUAUGGCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dmo-Mir-67-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dmo-Mir-67-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
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| Variant | Dmo-Mir-67-v1 |
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| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAAAACUAAGAAUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUUCGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGAUAGAAUAUCCACAAAGCUAAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGAAAACUAAGAAUU-- -| A CCU G UUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGAUG A GAUAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACUAC U CAAAUCGAAACACCUAUAA U^ - CCU A CUAUGGCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dmo-Mir-67-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dmo-Mir-67-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UCACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
|
