| MirGeneDB ID | Dno-Mir-506-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-506-P1i Dno-Mir-506-P1j Dno-Mir-506-P1k Dno-Mir-506-P1l Dno-Mir-506-P2b Dno-Mir-506-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-506-P4b Cfa-Mir-506-P4b Cja-Mir-506-P4 Cpo-Mir-506-P4 Eca-Mir-506-P4a Eca-Mir-506-P4b Hsa-Mir-506-P4 Laf-Mir-506 Mml-Mir-506-P4 Mmr-Mir-506-P4 Mmu-Mir-506-P4 Ocu-Mir-506-P4 Pab-Mir-506-P4 Rno-Mir-506-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH571138: 1950414-1950474 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACUCAGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAUCUUUAGCCACUCUGUGUGCAGUGCCCUACUCAGGAAGGUUCAGUUAAGUAUUUAGACUAUAAUAUUAACCGCACCCUUCUGAGUAGAGUAAUGCUCAACUAUGACGCCAUUUGGGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAUCUUUAGCCACUCUG--| U G C A UCA GUAUUUAG UG GCA UGC CUACUCAGGA GGU GUUAA \ AC CGU AUG GAUGAGUCUU CCA CAAUU A GGGGGUUUACCGCAGUAUCA^ U A A C CGC AUAAUAUC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-506-P4_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACUCAGGAAGGUUCAGUUAAGU -23
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dno-Mir-506-P4_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUAACCGCACCCUUCUGAGUAGA -61
Get sequence
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