| MirGeneDB ID | Dno-Mir-506-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-506-P1i Dno-Mir-506-P1j Dno-Mir-506-P1k Dno-Mir-506-P1l Dno-Mir-506-P2b Dno-Mir-506-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-506-P3 Cfa-Mir-506-P3a Cfa-Mir-506-P3b Cja-Mir-506-P3 Eca-Mir-506-P3 Hsa-Mir-506-P3 Laf-Mir-506 Mml-Mir-506-P3 Mmr-Mir-506-P3 Ocu-Mir-506-P3 Pab-Mir-506-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH564535: 697744-697800 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P3) |
Mir-506-P2b
JH564535: 655807-655864 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P1i JH564535: 672065-672122 [+] UCSC Ensembl Mir-506-P1j JH564535: 675854-675911 [+] UCSC Ensembl Mir-506-P1k JH564535: 690101-690158 [+] UCSC Ensembl Mir-506-P3 JH564535: 697744-697800 [+] UCSC Ensembl Mir-506-P1l JH564535: 715717-715774 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | GAUUGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGCCAUCACCUUCAGCUGAGUGCAGUGCCCUACUCCAGAGGGUGUCAUUCACUAAGAUAAAACAUGAUUGUCACCUUUUUGAGUAGAGCAAUGCACAUCAUGUAUAAUGUACAUGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGCCAUCACCUUCAGCU- -| G C C U U CUAAGA GA GUGCA UGC CUACUC AGAGGGUG CA UCA \ CU CACGU ACG GAUGAG UUUUCCAC GU AGU U UGGUACAUGUAAUAUGUA A^ A A U U U ACAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-506-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACUCCAGAGGGUGUCAUUCACU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-506-P3_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UGAUUGUCACCUUUUUGAGUAGA -57
Get sequence
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