| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-2584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2584 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-2584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2R: 10767146-10767208 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2584) |
Mir-989
2R: 10739800-10739943 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2584 2R: 10767146-10767208 [+] UCSC Ensembl Mir-2-P8 2R: 10806835-10806895 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAGAGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCGUCCCUACUUCCUGAAACAUCACGAAUGUGAGUAAAUCUACCUCUUUGAUAUUGCAAUUUUACUAAAAAGAGGUCUAUUUUUGCACACAGCCGUUGACAGGAUCAUCGAUGAUGGCAUGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGCGUCCCUACUUCCUGAAACA- - AA A UCU--| GAUAUUGCA UC ACG UGUG GUAAA ACCUCUUU \ AG UGC ACAC CGUUU UGGAGAAA A AGUACGGUAGUAGCUACUAGGAC U CG A UUAUC^ AAUCAUUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-2584_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0012529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGAGUAAAUCUACCUCUUUGA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-2584_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAAGAGGUCUAUUUUUGCACACAG -63
Get sequence
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