| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-982-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-982 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-982c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dsi-Mir-982-P1 Dsi-Mir-982-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 3953288-3953349 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-982-P3) |
Mir-982-P3
X: 3953288-3953349 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2582-P2 X: 3953548-3953605 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P2 X: 3953690-3953747 [-] UCSC Ensembl Mir-2582-P1 X: 3954183-3954240 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P1 X: 3954323-3954388 [-] UCSC Ensembl Mir-303 X: 3955015-3955071 [-] UCSC Ensembl Mir-983 X: 3957115-3957173 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UAUUGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUCAAGUUAAAAAACGAAAUCAUGCGAGAUCUUGGACAAAUAUCAAGUAGAUUAUUAUUAUACAUCAAUUUAUUGUUAUUUGUCCUUGAACUUAAUUGUUUUACAGCUGCAAAAAAAAAAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UAUCAAGUUAAAAAACG--| U UGC A UU UCA UAUUAUU AAA CA GAG UC GGACAAAUA AGUAGAU \ UUU GU UUC AG CCUGUUUAU UUAUUUA A UAAAAAAAAAACGUCGACA^ U UAA A UU UG- ACUACAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-982-P3_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0037359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUUGGACAAAUAUCAAGUAGAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-982-P3_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UUAUUGUUAUUUGUCCUUGAAC -62
Get sequence
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