| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-992 Dya-Mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2R: 16997777-16997837 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-992) |
Mir-92-P5
2R: 16995821-16995880 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P6 2R: 16995943-16996003 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 16996101-16996160 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P8 2R: 16996240-16996300 [-] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 16997663-16997724 [-] UCSC Ensembl Mir-992 2R: 16997777-16997837 [-] UCSC Ensembl Mir-7 2R: 17018215-17018276 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CCUUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUUGAGGAAUCUAGACAUGAUUUUCGCAAGUGCCUGGUUUCAGAGAGGUGUAAUUUUUGUUGUAUAGUACCCUUUUUUGGAACCAAGCCCUUUGAGAAACUUACCUGCGGGGUAUAUCAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GUUGAGGAAUCUAGACAUGA---| C U C U AUUUUUG UUUUCG AAG GC UGGUUUCAGAGAGG GUA \ AAGAGU UUC CG ACCAAGGUUUUUUC CAU U AAACUAUAUGGGGCGUCCAUUCA^ - C A C GAUAUGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-992_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0012491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCCUGGUUUCAGAGAGGUGUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-992_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CCCUUUUUUGGAACCAAGCCCU -61
Get sequence
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