| MirGeneDB ID | Gga-Mir-146-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-146 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Chicken (Gallus gallus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | gga-mir-146c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Gga-Mir-146-P1 Gga-Mir-146-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-146-P2 Ami-Mir-146-P2 Cli-Mir-146-P2 Cmi-Mir-146-P2 Cpi-Mir-146-P2 Ebu-Mir-146 Gja-Mir-146-P2 Lch-Mir-146-P2 Mun-Mir-146-P2-v1 Pbv-Mir-146-P2 Pma-Mir-146 Spt-Mir-146-P2 Sto-Mir-146-P2 Tgu-Mir-146-P2 Xla-Mir-146-P2a Xla-Mir-146-P2b Xtr-Mir-146-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Gallus_gallus.GRCg6a) |
4: 88746723-88746787 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAUGUGACGAAUCUUGGCAGUUCCCAGCUCUGAGAACUGAAUUCCAUGGACUGGUUUCAAUUCCAUGCGUUCAGUCCAUGGUAUUCAGUUCUCUAGCUUGGCUGCAUCAAACUUCACAACUGCUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAUGUGACGAAUCUUGGCA- UC -| CU U GUUUCAAU GU CC AGCU GAGAACUGAAU CCAUGGACUG U CG GG UCGA CUCUUGACUUA GGUACCUGAC C AUCGUCAACACUUCAAACUA UC U^ U- U UUGCGUAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Gga-Mir-146-P2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGAACUGAAUUCCAUGGACUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Gga-Mir-146-P2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0007736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- GUCCAUGGUAUUCAGUUCUCUA -65
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: gga-miR-146c-3p miRDB: MIMAT0007736 |






