| MirGeneDB ID | Hsa-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-769 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hsa-mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-769 Cfa-Mir-769 Cja-Mir-769 Cpo-Mir-769 Dno-Mir-769 Eca-Mir-769-P4 Eca-Mir-769-P5 Ete-Mir-769 Laf-Mir-769-P1 Laf-Mir-769-P2 Laf-Mir-769-P3 Mml-Mir-769 Mmr-Mir-769 Pab-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (hg38) |
chr19: 46018961-46019021 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCCUUGGUGCUGAUUCCUGGGCUCUGACCUGAGACCUCUGGGUUCUGAGCUGUGAUGUUGCUCUCGAGCUGGGAUCUCCGGGGUCUUGGUUCAGGGCCGGGGCCUCUGGGUUCCAAGCACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGCCUUGGUGCUGAUUC--| G C UG U U G GUGAUGU CU GGCUCUGA C AGACCUC GGG UCU AGCU \ GG CCGGGACU G UCUGGGG CUC AGG UCGA U CACGAACCUUGGGUCUCCG^ G U GU C U G GCUCUCG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. Although the 3' uridine is templated the 3' DcRNA reads suggest that this is a Group 2 miRNA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Hsa-Mir-769_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0003886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGACCUCUGGGUUCUGAGCU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003886 TargetScanVert: hsa-miR-769-5p TargetMiner: hsa-miR-769-5p miRDB: MIMAT0003886 |
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| Star sequence | Hsa-Mir-769_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0003887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CUGGGAUCUCCGGGGUCUUGGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003887 TargetScanVert: hsa-miR-769-3p TargetMiner: hsa-miR-769-3p miRDB: MIMAT0003887 |






