| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7395 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mdo-mir-7395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. domestica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. domestica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
X: 47661482-47661537 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7395) |
Mir-7392-P1b
X: 47647594-47647650 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-7393 X: 47653725-47653778 [+] UCSC Ensembl Mir-7392-P1a X: 47656551-47656607 [+] UCSC Ensembl Mir-7394-P1 X: 47660934-47660987 [+] UCSC Ensembl Mir-7395 X: 47661482-47661537 [+] UCSC Ensembl Mir-7394-P2 X: 47667188-47667241 [+] UCSC Ensembl Mir-7397 X: 47672118-47672173 [+] UCSC Ensembl Mir-7394-P3 X: 47675602-47675655 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGACCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUGGAGCAUCAUAAAUGGGUUUUCCCAGGUACACCUAUACUCCGGUAACAUAUUCCUCCACAUAUGACCAGGGUAUAUGUGUUCCUGGUAUAUAUCUGUUUGUACUAAUUCUCUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUUGGAGCAUCAUAAAU- UUUC-| U C C AA AUUCC GGGU CCAGG ACAC UAUACUC GGU CAU U UCUA GGUCC UGUG AUAUGGG CCA GUA C GUCUCUUAAUCAUGUUUG UAUAU^ U U A -- UACAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mdo-Mir-7395_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0028888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACACCUAUACUCCGGUAACAU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7395-5p |
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| Mature sequence | Mdo-Mir-7395_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0028889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AUGACCAGGGUAUAUGUGUUCC -56
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7395-3p |
