| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-26-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmr-mir-26b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-26-P1 Mmr-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-26-P2 Bta-Mir-26-P2 Cfa-Mir-26-P2 Cja-Mir-26-P2 Cli-Mir-26-P2 Cpi-Mir-26-P2 Cpo-Mir-26-P2 Dno-Mir-26-P2 Dre-Mir-26-P2a Eca-Mir-26-P2 Ete-Mir-26-P2 Gga-Mir-26-P2 Gja-Mir-26-P2 Gmo-Mir-26-P2a Gmo-Mir-26-P2b Hsa-Mir-26-P2 Laf-Mir-26-P2 Lch-Mir-26-P2 Loc-Mir-26-P2 Mal-Mir-26-P2a Mal-Mir-26-P2b Mdo-Mir-26-P2 Mml-Mir-26-P2 Mmu-Mir-26-P2 Mun-Mir-26-P2 Neu-Mir-26-P2 Oan-Mir-26-P2 Ocu-Mir-26-P2 Pab-Mir-26-P2 Pbv-Mir-26-P2 Pma-Mir-26-o2 Rno-Mir-26-P2 Sha-Mir-26-P2 Spt-Mir-26-P2 Sto-Mir-26-P2 Tgu-Mir-26-P2 Tni-Mir-26-P2b Xla-Mir-26-P2e Xla-Mir-26-P2f Xtr-Mir-26-P2c Xtr-Mir-26-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007668.1: 19750862-19750918 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-26-P2) |
Mir-320-P1c
CM007668.1: 19701191-19701244 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-26-P2 CM007668.1: 19750862-19750918 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCCUCUUGCCCCACUCUGCCCGGGACCCAGUUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUUGUGUGCUGUCCAGCCUGUUCUCCAUUACUUGGCUCGGGGACCGGUGCCCUGCAACCUUGGGGUGAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCCUCUUGCCCCACUCU- - GA -| U UC GUGUG GC CCGG CCC AGU CAAGUAAU AGGAUAGGUU \ CG GGCC GGG UCG GUUCAUUA UCUUGUCCGA C AGUGGGGUUCCAACGUCC U AG C^ - CC CCUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mmr-Mir-26-P2_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0049145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mmr-Mir-26-P2_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CCUGUUCUCCAUUACUUGGCUC -57
Get sequence
|
