| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-378-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-378 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-378-P1 Mmr-Mir-378-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-378 Cfa-Mir-378 Cja-Mir-378 Cpo-Mir-378 Dno-Mir-378 Eca-Mir-378 Ete-Mir-378 Hsa-Mir-378 Laf-Mir-378 Mml-Mir-378 Mmu-Mir-378 Ocu-Mir-378 Pab-Mir-378 Rno-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. murinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007670.1: 77215641-77215697 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCCCUUGAGCUAUGGGAUGUCCCAUAUUGGCUUUUAUUCCACUGUCAGUGACUGACUAAGAGAGCACUGGACUUGGAGUCAGAAGUCAUGAGGCUCCUAUCCCAGCUUUGCCACUAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCCCUUGAGCUAUGGGAU-----| C UAU - CUG ACUGAC GUC CA UGGCUUUU AUUCCA UCAGUG U CGG GU ACUGAAGA UGAGGU GGUCAC A AAUCACCGUUUCGACCCUAUCCU^ A --- C UCA GAGAGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-378-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUUUAUUCCACUGUCAGUGA -21
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-378-P3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- ACUGGACUUGGAGUCAGAAGUC -57
Get sequence
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