| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-378 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-378a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-378 Cfa-Mir-378 Cja-Mir-378 Cpo-Mir-378 Dno-Mir-378 Eca-Mir-378 Ete-Mir-378 Hsa-Mir-378 Laf-Mir-378 Mml-Mir-378 Mmr-Mir-378-P1 Mmr-Mir-378-P2 Mmr-Mir-378-P3 Ocu-Mir-378 Pab-Mir-378 Rno-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr18: 61397837-61397896 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAGCCAGGGGGUGACAGAGCCACCCAGGGCUCCUGACUCCAGGUCCUGUGUGUUACCUCGAAAUAGCACUGGACUUGGAGUCAGAAGGCCUGAGUGGAGUCACCUUCCCCGCUCUCUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCAGCCAGGGGGUGACA- G-| C G C U GUUACC GA CCAC CAGG CU CUGACUCCAGGUCC GUGU U CU GGUG GUCC GA GACUGAGGUUCAGG CACG C GGUCUCUCGCCCCUUCCA GA^ A G A U AUAAAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-378_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0000742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000742 TargetScanVert: mmu-miR-378a-5p miRDB: MIMAT0000742 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-378_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0003151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- ACUGGACUUGGAGUCAGAAGGC -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003151 TargetScanVert: mmu-miR-378a-3p miRDB: MIMAT0003151 |
