| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-149 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-149 Cfa-Mir-149 Cja-Mir-149 Cpo-Mir-149 Dno-Mir-149 Eca-Mir-149 Ete-Mir-149 Hsa-Mir-149 Laf-Mir-149 Mml-Mir-149 Mmr-Mir-149 Ocu-Mir-149 Pab-Mir-149 Rno-Mir-149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr1: 92850381-92850442 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCCCGGGGCCCUCAGGCCAGUGCCCAGGCUCUGGCUCCGUGUCUUCACUCCCGUGUUUGUCCGAGGAGGGAGGGAGGGACGGGGGCGGUGCUGGGGCAACUGGAACAGCGCAGGUCACCGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCCCGGGGCCCUCAGG- -| A U G G A GUGUUUG CCAG UGCCC GGC CUG CUCCGU UCUUC CUCCC \ GGUC ACGGG UCG GGC GGGGCA GGAGG GAGGG U GGCCACUGGACGCGACAA A^ G U G G - AGGAGCC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-149_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCCC -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000159 TargetScanVert: mmu-miR-149-5p miRDB: MIMAT0000159 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-149_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0016990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- GAGGGAGGGACGGGGGCGGUGC -62
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-149-3p miRDB: MIMAT0016990 |
