| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3068 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Rno-Mir-3068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr12: 87437685-87437747 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGGAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGCAAGGGGGACAGAGUAUGCGAGAGUAAUUGGAGUUCAUGCAAGUUCUAACCAGCUUACUCAGUAGCUGGGUGAAUUGCAGUACUCCAACAUUCUGCUUCCAUCUGCUCAGUUCUCAUGCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGCAAGGGGGACAGAGUAU----| G AA UCA G UAA AGCUUAC GC AGAGU UUGGAGU UGCAA UUC CC U CG UCUUA AACCUCA ACGUU AAG GG C UCGUACUCUUGACUCGUCUACCUU^ - C- UG- - UG- UCGAUGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There are Dicer cuts on the 3p arm -1 and -2 relative to what is annoated here. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3068_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUGGAGUUCAUGCAAGUUCUAACC -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3068-5p miRDB: MIMAT0014842 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3068_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- GGUGAAUUGCAGUACUCCAACA -63
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3068-3p miRDB: MIMAT0014843 |
