| MirGeneDB ID | Neu-Mir-7318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7318 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Neu-Mir-7318-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7318 Sha-Mir-7318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051819.1: 155252590-155252648 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7318) |
Mir-7318
CM051819.1: 155252590-155252648 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7318-as CM051819.1: 155252592-155252650 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGCGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGUGCUUUUCUUGUCAAUAGUACGCAUGCCCUCAGAUUUCUAUACGCAUUUGUAUUCUCUACAUGAAUGCGUAUAGAAAUCUGAGGCCAUGAGUAUUAUAAUCGCCCCUUUUCCUGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50
UUGUGCUUUUCUUGUCA--| G C GUAUUC
AUAGUAC CAUG CCUCAGAUUUCUAUACGCAUUU \
UAUUAUG GUAC GGAGUCUAAAGAUAUGCGUAAG U
GGGUCCUUUUCCCCGCUAA^ A C UACAUC
110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-7318_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUCAGAUUUCUAUACGCAUUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-7318_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUGCGUAUAGAAAUCUGAGGCC -59
Get sequence
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