| MirGeneDB ID | Neu-Mir-7370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7370 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7370 Sha-Mir-7370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 69204543-69204601 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7370) |
Mir-7370
CM051820.1: 69204543-69204601 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7371-o29 CM051820.1: 69242583-69242643 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UUCACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUCUUUCUUCUCUCCCUUCCAGUUGCCCCAUUCACACCAGAUGCUCCCUUUUUUGAAUUCUAUCAAAAGGGAUAUCCUGUGUGAAAGGGGUUGCUGGAGCUGAAUCCCUGAGCAGCAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGUCUUUCUUCUCUCCC--| U A CA C UUGAA UUCCAGU GCCCC UUCACAC GAUG UCCCUUUU U GAGGUCG UGGGG AAGUGUG CUAU AGGGAAAA U AACGACGAGUCCCUAAGUC^ U A UC - CUAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Mir-7370_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUCACACCAGAUGCUCCCUUUU -23
Get sequence
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| Star sequence | Neu-Mir-7370_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AAGGGAUAUCCUGUGUGAAAGG -59
Get sequence
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