| MirGeneDB ID | Neu-Mir-7383-P5c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7383 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Neu-Mir-7383-P5a Neu-Mir-7383-P5b Neu-Mir-7383-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 19451016-19451074 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7383-P5c) |
Mir-7383-P6
CM051820.1: 19407975-19408033 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-7383-P5a CM051820.1: 19451016-19451074 [+] UCSC Ensembl Mir-7383-P5c CM051820.1: 19451016-19451074 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAGGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCUCUCACCUCCUCAUGACUGGAGUAUUCCAAGGUACCUGAGGUCCUCUUAUUUUAUAUUGGUUGUAAGAGGCUCCAGCUCCCUUUGUCUACCCCAGUAUAAAACUCCACUCCCACUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCUCUCACCUCCUCAUG--| A UUCC UAC AG U UUUUAU ACUGG GUA AAGG CUG G CCUCUUA A UGACC CAU UUCC GAC C GGAGAAU U GUCACCCUCACCUCAAAAUA^ C CUGU CUC CU - GUUGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut +1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Mir-7383-P5c_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAGGUACCUGAGGUCCUCUUA -22
Get sequence
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| Star sequence | Neu-Mir-7383-P5c_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AGAGGCUCCAGCUCCCUUUGU -59
Get sequence
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